Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Defa35E9QLQ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa35E9QLQ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms