Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc74aE9Q9U8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc74aE9Q9U8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms