Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Susd1E9Q3H4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd1E9Q3H4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms