Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrp3E9Q1T6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lrp3E9Q1T6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms