Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7Q2

Smim20, Small integral membrane protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim20D3Z7Q2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim20D3Z7Q2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Smim20D3Z7Q2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms