Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin3aA2AIR5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3aA2AIR5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3aA2AIR5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3aA2AIR5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3aA2AIR5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3aA2AIR5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin3aA2AIR5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3aA2AIR5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin3aA2AIR5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms