Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc173A0JLY1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc173A0JLY1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms