Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ino80eA0A0U1RP99 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ino80eA0A0U1RP99 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms