Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4921501E09RikA0A0R4J054 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms