Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRG3Q9Y2Y8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRG3Q9Y2Y8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms