Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Skp1Q9WTX5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Skp1Q9WTX5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms