Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDZRN3Q9UPQ7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms