Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPARGC1AQ9UBK2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPARGC1AQ9UBK2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms