Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp11cQ9QZW0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp11cQ9QZW0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp11cQ9QZW0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atp11cQ9QZW0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp11cQ9QZW0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp11cQ9QZW0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp11cQ9QZW0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atp11cQ9QZW0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp11cQ9QZW0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms