Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cln8Q9QUK3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cln8Q9QUK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms