Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRN3Q9NYV6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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