Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc4apQ9JLV2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc4apQ9JLV2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms