Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ap3m1Q9JKC8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms