Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc22Q9JIG7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc22Q9JIG7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc22Q9JIG7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms