Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPF2Q9HAU5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UPF2Q9HAU5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPF2Q9HAU5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms