Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3s1Q9DCR2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3s1Q9DCR2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms