Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp5oQ9DB20 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5oQ9DB20 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms