Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm2aQ9DAR1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cmtm2aQ9DAR1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms