Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D8N1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms