Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gabra4Q9D6F4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabra4Q9D6F4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabra4Q9D6F4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gabra4Q9D6F4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms