Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms