Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D4W2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D4W2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms