Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tchhl1Q9D3P1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tchhl1Q9D3P1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms