Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgo1Q9CXH7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sgo1Q9CXH7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms