Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930553M12RikQ9CUH1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930553M12RikQ9CUH1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930553M12RikQ9CUH1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930553M12RikQ9CUH1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930553M12RikQ9CUH1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930553M12RikQ9CUH1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930553M12RikQ9CUH1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930553M12RikQ9CUH1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930553M12RikQ9CUH1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930553M12RikQ9CUH1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms