Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp5sQ9CRA7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp5sQ9CRA7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms