Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl28Q9CR40 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl28Q9CR40 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms