Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim8Q9CQQ0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim8Q9CQQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smim8Q9CQQ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms