Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnaja3Q99M87 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms