Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GatbQ99JT1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GatbQ99JT1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms