Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmd6Q99JI4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmd6Q99JI4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms