Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZNF354BQ96LW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF354BQ96LW1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF354BQ96LW1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF354BQ96LW1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF354BQ96LW1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms