Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tgs1Q923W1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tgs1Q923W1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tgs1Q923W1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgs1Q923W1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tgs1Q923W1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms