Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Afg3l1Q920A7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Afg3l1Q920A7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Afg3l1Q920A7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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