Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarca5Q91ZW3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarca5Q91ZW3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms