Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd3Q91WC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Setd3Q91WC0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms