Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms