Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam20bQ8VCS3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam20bQ8VCS3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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