Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Amigo3Q8C2S7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Amigo3Q8C2S7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Amigo3Q8C2S7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms