Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
5730596B20RikQ8BQ08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms