Protein–RNA interactions for Protein: Q8BN59

Larp6, La-related protein 6, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp6Q8BN59 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Larp6Q8BN59 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Larp6Q8BN59 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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