Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cyp4f39Q8BGU0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp4f39Q8BGU0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms