Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubash3bQ8BGG7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ubash3bQ8BGG7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms