Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc172Q810N9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc172Q810N9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms