Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ckap2lQ7TS74 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms